Киборг 009 и войны монстров

После побега от организации «Чёрный призрак» киборги, ранее восставшие против неё, расселились по всему миру и ведут мирную жизнь. Ситуация меняется, когда необычное существо, напоминающее динозавра, начинает атаковать города и людей с помощью звуковых волн. Доктор Айзек Гилмор приходит к выводу, что за этими нападениями стоит «Чёрный призрак», и принимает меры для повторного сбора киборгов.

Группу возглавляет Джо Симамура, известный как Киборг 009. К сопротивлению присоединяется загадочная Елена, утверждающая, что стала сиротой в результате атак монстра. Киборги используют подводный летательный аппарат «Дельфин», оснащённый средствами противодействия ультразвуку. Их задача — обнаружить монстра и найти новое убежище «Чёрного призрака».