Синко с вихром и тысячелетняя магия

Действие происходит в 1955 году в городе Хофу, расположенном среди рисовых полей. На месте этого города тысячу лет назад находилась древняя столица Суо-но-Куни. Синко Аоки учится в третьем классе начальной школы и происходит из уважаемой местной семьи. Она является лидером группы детей и проявляет активность в исследовании окружающего мира. В класс Синко переводится новая ученица из Токио по имени Киико Симацу. Киико испытывает дискомфорт в тихой провинциальной местности, а местные дети относятся к ней с осторожностью. Синко и Киико постепенно сближаются и начинают проводить вместе всё свободное время.

В ходе прогулок девочки обнаруживают исследовательскую группу, проводящую раскопки на месте древнего здания. Выясняется, что это был дом губернатора, в котором жила его дочь примерно того же возраста, что и Синко с Киико. Сюжет строится вокруг знакомства девочек с историей этого места и их попыток узнать больше о жизни дочери губернатора. Основное развитие событий связано с взаимодействием персонажей и их исследованием прошлого.