Ямато навсегда: Мятежник 3199

Сюжет разворачивается после событий, описанных в «Uchuu Senkan Yamato 2205: Aratanaru Tabidachi». Главный герой, Синсуке Ямамото, получает задание от командования Земного флота. Ему поручено возглавить миссию по установлению контакта с неизвестной цивилизацией, обнаруженной на окраине галактики. Космический корабль «Ямато» отправляется в новый рейс, имея на борту экипаж, состоящий из опытных пилотов и инженеров. Цель экспедиции — выяснить намерения инопланетной расы и оценить потенциальную угрозу для Земли.

В ходе путешествия экипаж сталкивается с аномалиями пространства-времени и следами древних технологий. Выясняется, что цивилизация, с которой пытаются установить контакт, обладает знаниями, способными изменить баланс сил в галактике. Однако их истинные мотивы остаются неясными. Параллельно развивается линия взаимоотношений между членами экипажа, где каждый сталкивается с личными дилеммами и последствиями прошлых миссий. Основная интрига заключается в том, удастся ли команде «Ямато» предотвратить конфликт и раскрыть тайну, скрытую за сигналами из далёкого космоса.